【数据分析】基于adonis2与pairwise.adonis2的群组差异分析教程

news2025/6/7 19:17:10

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文章目录

    • 介绍
    • 加载R包
    • 数据下载
    • 导入数据
    • 数据预处理
    • adonis分析
    • pairwise.adonis2分析
    • 总结
    • 系统信息

介绍

本教程主要用于执行和分析基于距离矩阵的多样性和群落结构分析,特别是通过adonis2pairwise.adonis2函数来评估不同群组间的差异。代码分为几个主要部分:数据准备、ADONIS分析、结果输出。

数据准备

  1. 数据导入:从本地文件中导入距离矩阵(distance.xls)和元数据(group.xls)。距离矩阵用于表示样本之间的相似性或差异性,元数据包含样本的分组信息。

  2. 数据预处理:将元数据中的分组信息转换为因子类型,并确保其水平是唯一的。然后,根据元数据中的样本顺序调整距离矩阵的行和列,以确保它们与元数据一致。

ADONIS分析

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