记录安装Cytoscape的过程

news2025/7/22 22:17:23

一、安装前的准备工作

1、先java

看了大佬们的安装教程:
看到说先要安装对应的Java才能下载相应的cytoscape,因cytoscape是基于java的软件。
cytoscape安装教程1
cytoscape安装教程2

然后,自查了自己电脑上的Java版本,应该为jdk 11,对应cytoscape 3.9.1


在这里插入图片描述


2、在Java基础上,下载安装cytospace

(1) 下载安装cytospace过程中出现的问题

然后,按照安装教程来下载windows-64bit 的cytoscape版本,然后下载到差不多 1 4 \frac{1}{4} 41接近50m左右,共270多m,说下载失败,需要获得授权。


在这里插入图片描述


(2)解决问题

然后,有文章说可以在官网测试
但我点击不了windows.bat,来进行测试,试图安装System Checker Script[图a],出现无法访问网站[图b],可能需要翻墙。


图一
图二


(3)无法翻墙的基础上,去解决问题

发现了cytoscape的安装及使用,然后直接这篇博客中的百度网盘中的cytoscape.exe应用程序进行下载,因本机有java11版本,所以只安装了cytoscape,没有安装附带的Java。

(4)安装结束

安装完后,出现弹窗,说cyee版本改变,不知道会不会对后续使用有影响。


在这里插入图片描述


为了以防万一,搜索了一些安装后问题的教程:
Cytospace安装后无法打开,其中有其他的相关情况的博客链接。

三、安装后的使用

见互作网络可视化-Cytoscape简单教程
目前,没有数据文件,暂未开始使用。

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