人体蛋白质异构体图谱
摘要新兴研究凸显了蛋白异构体的重要性——尽管源自同一基因,蛋白异构体通常具有独特的功能作用,且有助于生理多样性、疾病机制及表型变异的形成。然而,目前缺乏全面表征蛋白异构体的异构体水平资源。IsoProDB是个整合统一的一站式数据库,对来自RefSeq和UniProtKB的蛋白异构体进行序列比对,支持人类蛋白异构体的跨序列可视化分析。该数据库整合了多种特征信息,包括结构域架构、内在无序区域、序列变异、跨膜拓扑结构,以及来自多个资源的52种不同翻译后修饰(PTMs),并将其映射至蛋白异构体。目前,IsoProDB支持研究人员对源自20,536个蛋白编码基因的110,149个蛋白异构体,就所有整合特征进行基因水平的比较分析,并提供高效的可视化工具。这有助于深入了解保守与非保守PTM位点、结构域、异构体特异性膜定位、变异对蛋白功能的影响,以及跨蛋白异构体的疾病相关性。随着特定异构体逐渐成为多种疾病的标志物和诊疗靶点,IsoProDB已与多个全球资源整合,方便研究人员导航和探索异构体的多组学信息。数据库URLhttps://ciods.in/isoprodbGitHubhttps://github.com/sree-pathappillil/IsoProtDBrajeshraju@yenepoya.edu.in#IsoProDB#蛋白异构体#翻译后修饰#跨膜拓扑结构#结构域#内在无序区域#序列变异#数据库材料与方法IsoProDB的开发技术框架图1IsoProDB的开发所使用的方法和资
本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处:http://www.coloradmin.cn/o/2594992.html
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