深度学习在RNA分子动力学中的特征提取与应用指南

引言：RNA结构动力学与AI的融合

RNA作为生命活动的核心分子，其动态构象变化直接影响基因调控、蛋白合成等关键生物过程。分子动力学（Molecular Dynamics, MD）模拟通过求解牛顿运动方程，可获取RNA原子级运动轨迹（时间尺度通常为纳秒至微秒）。然而，MD产生的TB级数据包含高维噪声，传统分析方法面临巨大挑战。本指南将系统介绍如何结合深度学习方法，从RNA-MD数据中提取关键特征并构建预测模型。

第一部分：分子动力学基础与数据准备

1.1 RNA分子动力学模拟流程

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