大家好，我是邓飞，这里介绍一下如何使用Haploview进行单倍型的分析。

计划分为三篇文章：

• 第一篇：Haploview做单倍型教程1–软件安装
• 第二篇：Haploview做单倍型教程2-分析教程
• 第三篇：Haploview做单倍型教程3–结果解读

今天是第一篇。

下面是Haploview做的结果：

下面是LDblockShow做的结果：

两者结果是一致的。

Haploview因为是GUI界面，可以鼠标点点点的形式，所以更简单：

1. 软件下载

官网： https://www.broadinstitute.org/haploview/downloads#JAR

windows系统：

Linux系统：

2. 配置java环境

https://www.java.com/zh-CN/download/

下载安装好之后，在终端运行java，出现帮助文档，说明配置成功。

2.1 windows系统

cmd终端打开，键入java，出现下面界面，说明配置成功。

2.2 Linux系统

终端打开，键入java，出现下面界面，说明配置成功。

3. windows安装

安装好之后，打开HaploView软件：

打开软件：

4. Linux安装

终端下，键入命令：

java -jar Haploview.jar 

出现界面：

上面就是搞定了软件的安装。

下一篇介绍一下数据分析实操方法。

下下一篇介绍Haploview结果如何解读及如何微调结果。

欢迎继续关注。